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Showing metabocard for D-Xylose (BMDB0000098)
| Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Version | 1.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Creation Date | 2016-09-30 22:19:36 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Update Date | 2020-05-11 20:07:40 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BMDB ID | BMDB0000098 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Secondary Accession Numbers |
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| Metabolite Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Common Name | D-Xylose | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | D-D-d-xylose, also known as d-xylose or d-xylose, belongs to the class of organic compounds known as pentoses. These are monosaccharides in which the carbohydrate moiety contains five carbon atoms. D-D-d-xylose exists as a solid, possibly soluble (in water), and an extremely weak basic (essentially neutral) compound (based on its pKa) molecule. D-D-d-xylose exists in all living species, ranging from bacteria to humans. In cattle, D-d-xylose is involved in the metabolic pathway called the nucleotide sugars metabolism pathway. D-D-d-xylose is a potentially toxic compound. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms |
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| Chemical Formula | C5H10O5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Average Molecular Weight | 150.1299 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Monoisotopic Molecular Weight | 150.05282343 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IUPAC Name | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Traditional Name | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CAS Registry Number | 58-86-6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMILES | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Identifier | InChI=1S/C5H10O5/c6-2-1-10-5(9)4(8)3(2)7/h2-9H,1H2/t2-,3+,4-,5?/m1/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Key | SRBFZHDQGSBBOR-IOVATXLUSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | belongs to the class of organic compounds known as pentoses. These are monosaccharides in which the carbohydrate moiety contains five carbon atoms. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Super Class | Organic oxygen compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Class | Organooxygen compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sub Class | Carbohydrates and carbohydrate conjugates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Direct Parent | Pentoses | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative Parents | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Substituents |
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| Molecular Framework | Aliphatic heteromonocyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Descriptors |
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| Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Status | Detected but not Quantified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Origin |
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| Biofunction | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Application | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular locations |
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| Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| State | Solid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Properties |
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| Predicted Properties | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spectra |
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| Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular Locations |
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| Biospecimen Locations |
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| Pathways |
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| Normal Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Abnormal Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HMDB ID | HMDB0000098 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| FooDB ID | FDB005944 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KNApSAcK ID | C00007290 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemspider ID | 119104 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG Compound ID | C00181 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BiGG ID | 34162 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikipedia Link | Xylose | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| METLIN ID | 314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PubChem Compound | 135191 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEBI ID | 53455 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synthesis Reference | Lavarack, B. P.; Griffin, G.; Rodman, D. Optimizing the autohydrolysis of bagasse to extract D-xylose. Proceedings of the Conference of the Australian Society of Sugar Cane Technologists (1999), 21st 394-400. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| General References | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzymes
- General function:
- Involved in binding
- Specific function:
- Not Available
- Gene Name:
- DHDH
- Uniprot ID:
- Q148L6
- Molecular weight:
- 36583.0
- General function:
- Involved in sodium ion binding
- Specific function:
- Involved in the sodium-dependent cotransport of myo-inositol (MI) with a Na(+):MI stoichiometry of 2:1. Exclusively responsible for apical MI transport and absorption in intestine. Also can transport D-chiro-inositol (DCI) but not L-fructose. Exhibits stereospecific cotransport of both D-glucose and D-xylose. May induce apoptosis through the TNF-alpha, PDCD1 pathway. May play a role in the regulation of MI concentration in serum, involving reabsorption in at least the proximal tubule of the kidney.
- Gene Name:
- SLC5A11
- Uniprot ID:
- Q3ZC26
- Molecular weight:
- 73957.0