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Showing metabocard for D-Xylose (BMDB0000098)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 1.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2016-09-30 22:19:36 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2020-05-11 20:07:40 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BMDB ID | BMDB0000098 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary Accession Numbers |
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Metabolite Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Common Name | D-Xylose | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | D-D-d-xylose, also known as d-xylose or d-xylose, belongs to the class of organic compounds known as pentoses. These are monosaccharides in which the carbohydrate moiety contains five carbon atoms. D-D-d-xylose exists as a solid, possibly soluble (in water), and an extremely weak basic (essentially neutral) compound (based on its pKa) molecule. D-D-d-xylose exists in all living species, ranging from bacteria to humans. In cattle, D-d-xylose is involved in the metabolic pathway called the nucleotide sugars metabolism pathway. D-D-d-xylose is a potentially toxic compound. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
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Chemical Formula | C5H10O5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Molecular Weight | 150.1299 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Molecular Weight | 150.05282343 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | 58-86-6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C5H10O5/c6-2-1-10-5(9)4(8)3(2)7/h2-9H,1H2/t2-,3+,4-,5?/m1/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | SRBFZHDQGSBBOR-IOVATXLUSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | belongs to the class of organic compounds known as pentoses. These are monosaccharides in which the carbohydrate moiety contains five carbon atoms. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Organic oxygen compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Organooxygen compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Carbohydrates and carbohydrate conjugates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Pentoses | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Substituents |
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Molecular Framework | Aliphatic heteromonocyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors |
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Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Detected but not Quantified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Origin |
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Biofunction | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Application | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular locations |
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Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State | Solid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Properties |
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Predicted Properties | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra |
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Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations |
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Biospecimen Locations |
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Pathways |
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Normal Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Abnormal Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | HMDB0000098 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FooDB ID | FDB005944 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | C00007290 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | 119104 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | C00181 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | 34162 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Xylose | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | 314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | 135191 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | 53455 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Lavarack, B. P.; Griffin, G.; Rodman, D. Optimizing the autohydrolysis of bagasse to extract D-xylose. Proceedings of the Conference of the Australian Society of Sugar Cane Technologists (1999), 21st 394-400. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
General References | Not Available |
Enzymes
- General function:
- Involved in binding
- Specific function:
- Not Available
- Gene Name:
- DHDH
- Uniprot ID:
- Q148L6
- Molecular weight:
- 36583.0
- General function:
- Involved in sodium ion binding
- Specific function:
- Involved in the sodium-dependent cotransport of myo-inositol (MI) with a Na(+):MI stoichiometry of 2:1. Exclusively responsible for apical MI transport and absorption in intestine. Also can transport D-chiro-inositol (DCI) but not L-fructose. Exhibits stereospecific cotransport of both D-glucose and D-xylose. May induce apoptosis through the TNF-alpha, PDCD1 pathway. May play a role in the regulation of MI concentration in serum, involving reabsorption in at least the proximal tubule of the kidney.
- Gene Name:
- SLC5A11
- Uniprot ID:
- Q3ZC26
- Molecular weight:
- 73957.0