Showing metabocard for Glyoxylic acid (BMDB0000119)
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| Version | 1.0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Creation Date | 2016-09-30 22:19:46 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Update Date | 2020-05-21 16:26:52 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BMDB ID | BMDB0000119 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Secondary Accession Numbers |
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| Metabolite Identification | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Common Name | Glyoxylic acid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Glyoxylic acid, also known as glyoxylic acid or glyoxylic acid, belongs to the class of organic compounds known as carboxylic acids. Carboxylic acids are compounds containing a carboxylic acid group with the formula -C(=O)OH. Glyoxylic acid exists as a solid, possibly soluble (in water), and an extremely weak basic (essentially neutral) compound (based on its pKa) molecule. Glyoxylic acid exists in all living species, ranging from bacteria to humans. L-Alanine and glyoxylic acid can be converted into glycine and pyruvic acid; which is catalyzed by the enzyme serine--pyruvate aminotransferase. In cattle, glyoxylic acid is involved in the metabolic pathway called the alanine metabolism pathway. Glyoxylic acid is a potentially toxic compound. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms |
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| Chemical Formula | C2H2O3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Average Molecular Weight | 74.0355 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Monoisotopic Molecular Weight | 74.00039393 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IUPAC Name | 2-oxoacetic acid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Traditional Name | glyoxylic acid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CAS Registry Number | 298-12-4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMILES | OC(=O)C=O | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Identifier | InChI=1S/C2H2O3/c3-1-2(4)5/h1H,(H,4,5) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Key | HHLFWLYXYJOTON-UHFFFAOYSA-N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Taxonomy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | belongs to the class of organic compounds known as carboxylic acids. Carboxylic acids are compounds containing a carboxylic acid group with the formula -C(=O)OH. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Kingdom | Organic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Super Class | Organic acids and derivatives | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Class | Carboxylic acids and derivatives | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sub Class | Carboxylic acids | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Direct Parent | Carboxylic acids | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative Parents | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Substituents |
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| Molecular Framework | Aliphatic acyclic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Descriptors |
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| Ontology | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Status | Expected but not Quantified | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Origin |
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| Biofunction | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Application | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular locations |
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| Physical Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| State | Liquid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Properties |
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| Predicted Properties |
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| Spectra | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spectra | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biological Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular Locations |
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| Biospecimen Locations |
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| Pathways | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Normal Concentrations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Abnormal Concentrations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Links | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HMDB ID | HMDB0000119 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank ID | DB04343 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Phenol Explorer Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| FooDB ID | FDB007244 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KNApSAcK ID | C00001186 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemspider ID | 740 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG Compound ID | C00048 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc ID | GLYOX | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BiGG ID | 33659 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikipedia Link | Glyoxylic_acid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| METLIN ID | 3213 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PubChem Compound | 760 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEBI ID | 16891 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synthesis Reference | Jie, Yuanping; Song, Zhen. Method for preparing glyoxylic acid. Faming Zhuanli Shenqing Gongkai Shuomingshu (2007), 5pp. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| General References | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzymes
- General function:
- Involved in copper ion binding
- Specific function:
- Bifunctional enzyme that catalyzes the post-translational modification of inactive peptidylglycine precursors to the corresponding bioactive alpha-amidated peptides, a terminal modification in biosynthesis of many neural and endocrine peptides (PubMed:2059626). Alpha-amidation involves two sequential reactions, both of which are catalyzed by separate catalytic domains of the enzyme. The first step, catalyzed by peptidyl alpha-hydroxylating monoxygenase (PHM) domain, is the copper-, ascorbate-, and O2- dependent stereospecific hydroxylation (with S stereochemistry) at the alpha-carbon (C-alpha) of the C-terminal glycine of the peptidylglycine substrate (PubMed:2059626). The second step, catalyzed by the peptidylglycine amidoglycolate lyase (PAL) domain, is the zinc-dependent cleavage of the N-C-alpha bond, producing the alpha-amidated peptide and glyoxylate (PubMed:2059626). Similarly, catalyzes the two-step conversion of an N-fatty acylglycine to a primary fatty acid amide and glyoxylate (By similarity).
- Gene Name:
- PAM
- Uniprot ID:
- P10731
- Molecular weight:
- 108177.0
- General function:
- Amino acid transport and metabolism
- Specific function:
- Can metabolize asymmetric dimethylarginine (ADMA) via transamination to alpha-keto-delta-(NN-dimethylguanidino) valeric acid (DMGV). ADMA is a potent inhibitor of nitric-oxide (NO) synthase, and this activity provides mechanism through which the kidney regulates blood pressure (By similarity).
- Gene Name:
- AGXT2
- Uniprot ID:
- Q17QF0
- Molecular weight:
- 57226.0