Showing metabocard for Succinic acid semialdehyde (BMDB0001259)
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| Version | 1.0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Creation Date | 2016-09-30 22:43:11 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Update Date | 2020-05-19 22:00:56 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BMDB ID | BMDB0001259 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Secondary Accession Numbers |
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| Metabolite Identification | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Common Name | Succinic acid semialdehyde | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Succinic acid semialdehyde, also known as Succinic acid semialdehyde or Succinic acid semialdehyde, belongs to the class of organic compounds known as straight chain fatty acids. These are fatty acids with a straight aliphatic chain. Succinic acid semialdehyde is a drug. Succinic acid semialdehyde is a very hydrophobic molecule, practically insoluble (in water), and relatively neutral. Succinic acid semialdehyde exists in all living species, ranging from bacteria to humans. Succinic acid semialdehyde participates in a number of enzymatic reactions, within cattle. In particular, Succinic acid semialdehyde and L-glutamic acid can be biosynthesized from gamma-aminobutyric acid and oxoglutaric acid through its interaction with the enzyme 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial. In addition, Succinic acid semialdehyde can be converted into succinic acid; which is mediated by the enzyme succinate-semialdehyde dehydrogenase, mitochondrial. In cattle, succinic acid semialdehyde is involved in the metabolic pathway called the glutamate metabolism pathway. Succinic acid semialdehyde is a potentially toxic compound. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms |
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| Chemical Formula | C4H6O3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Average Molecular Weight | 102.0886 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Monoisotopic Molecular Weight | 102.031694058 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IUPAC Name | 4-oxobutanoic acid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Traditional Name | succinic semialdehyde | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CAS Registry Number | 692-29-5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMILES | OC(=O)CCC=O | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Identifier | InChI=1S/C4H6O3/c5-3-1-2-4(6)7/h3H,1-2H2,(H,6,7) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Key | UIUJIQZEACWQSV-UHFFFAOYSA-N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Taxonomy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | belongs to the class of organic compounds known as straight chain fatty acids. These are fatty acids with a straight aliphatic chain. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Kingdom | Organic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Super Class | Lipids and lipid-like molecules | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Class | Fatty Acyls | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sub Class | Fatty acids and conjugates | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Direct Parent | Straight chain fatty acids | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative Parents | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Substituents |
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| Molecular Framework | Aliphatic acyclic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Descriptors |
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| Ontology | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Status | Detected but not Quantified | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Origin |
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| Biofunction | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Application | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular locations |
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| Physical Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| State | Solid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Properties |
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| Predicted Properties |
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| Spectra | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spectra | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biological Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular Locations |
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| Biospecimen Locations |
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| Pathways |
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| Normal Concentrations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Abnormal Concentrations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Links | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HMDB ID | HMDB0001259 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank ID | DBMET01476 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Phenol Explorer Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| FooDB ID | FDB022516 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KNApSAcK ID | C00019682 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemspider ID | 1080 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG Compound ID | C00232 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc ID | SUCC-S-ALD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BiGG ID | 34331 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikipedia Link | Succinic semialdehyde | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| METLIN ID | 6114 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PubChem Compound | 1112 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEBI ID | 16265 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synthesis Reference | Bruce, R.; Sims, K.; Pitts, F. N., Jr. Synthesis and purification of succinic semialdehyde. Analytical Biochemistry (1971), 41(1), 271-3. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| General References | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzymes
- General function:
- Energy production and conversion
- Specific function:
- Catalyzes the cofactor-independent reversible oxidation of gamma-hydroxybutyrate (GHB) to succinic semialdehyde (SSA) coupled to reduction of 2-ketoglutarate (2-KG) to D-2-hydroxyglutarate (D-2-HG). L-3-hydroxybutyrate (L-3-OHB) is also a substrate for HOT when using 2-KG as hydrogen acceptor, resulting in the formation of D-2-HG (By similarity).
- Gene Name:
- ADHFE1
- Uniprot ID:
- A6QP15
- Molecular weight:
- 50343.0
- General function:
- Amino acid transport and metabolism
- Specific function:
- Catalyzes the conversion of gamma-aminobutyrate and L-beta-aminoisobutyrate to succinate semialdehyde and methylmalonate semialdehyde, respectively. Can also convert delta-aminovalerate and beta-alanine (By similarity).
- Gene Name:
- ABAT
- Uniprot ID:
- Q9BGI0
- Molecular weight:
- 56731.0
Reactions
| Gamma-Aminobutyric acid + Oxoglutaric acid → Succinic acid semialdehyde + L-Glutamic acid | details |