Showing metabocard for L-Lysine (BMDB0000182)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 1.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2016-09-30 22:20:37 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2020-06-04 22:22:06 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BMDB ID | BMDB0000182 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Common Name | L-Lysine | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | L-Lysine, also known as (S)-lysine or L-lysin, belongs to the class of organic compounds known as l-alpha-amino acids. These are alpha amino acids which have the L-configuration of the alpha-carbon atom. L-Lysine exists as a solid, possibly soluble (in water), and a very strong basic compound (based on its pKa) molecule. L-Lysine exists in all living species, ranging from bacteria to humans. In cattle, L-lysine is involved in the metabolic pathway called the biotin metabolism pathway. L-Lysine is a potentially toxic compound. L-Lysine has been found to be associated with several diseases known as citrullinemia type ii, neonatal-onset, autism, and leukemia; also l-lysine has been linked to several inborn metabolic disorders including histidinemia and fumarase deficiency. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms |
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Chemical Formula | C6H14N2O2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Molecular Weight | 146.1876 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Molecular Weight | 146.105527702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | (2S)-2,6-diaminohexanoic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | L-lysine | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | 56-87-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | NCCCC[C@H](N)C(O)=O | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C6H14N2O2/c7-4-2-1-3-5(8)6(9)10/h5H,1-4,7-8H2,(H,9,10)/t5-/m0/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | belongs to the class of organic compounds known as l-alpha-amino acids. These are alpha amino acids which have the L-configuration of the alpha-carbon atom. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Organic acids and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Carboxylic acids and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Amino acids, peptides, and analogues | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | L-alpha-amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Substituents |
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Molecular Framework | Aliphatic acyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors |
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Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Detected and Quantified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Origin |
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Biofunction | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Application | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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State | Solid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Properties |
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Predicted Properties |
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Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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HMDB ID | HMDB0000182 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | DB00123 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FooDB ID | FDB000474 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | C00001378 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | 5747 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | C00047 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | LYS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | 33655 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Lysine | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | 5200 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | 5962 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | LYS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | 18019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Rothstein, Morton. DL-Lysine-6-C14 and DL-a-aminoadipic acid-6-C14. Biochemical Preparations (1961), 8 85-8. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
General References |
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Enzymes
- General function:
- Involved in histone-lysine N-methyltransferase activity
- Specific function:
- Histone methyltransferase that specifically trimethylates 'Lys-9' of histone H3 using monomethylated H3 'Lys-9' as substrate. H3 'Lys-9' trimethylation represents a specific tag for epigenetic transcriptional repression by recruiting HP1 (CBX1, CBX3 and/or CBX5) proteins to methylated histones. Mainly functions in heterochromatin regions, thereby playing a central role in the establishment of constitutive heterochromatin at pericentric and telomere regions. H3 'Lys-9' trimethylation is also required to direct DNA methylation at pericentric repeats. SUV39H1 is targeted to histone H3 via its interaction with RB1 and is involved in many processes, such as cell cycle regulation, transcriptional repression and regulation of telomere length. May participate in regulation of higher-order chromatin organization during spermatogenesis. Recruited by the large PER complex to the E-box elements of the circadian target genes such as PER2 itself or PER1, contributes to the conversion of local chromatin to a heterochromatin-like repressive state through H3 'Lys-9' trimethylation (By similarity).
- Gene Name:
- SUV39H2
- Uniprot ID:
- Q32PH7
- Molecular weight:
- 46551.0
- General function:
- Involved in histone-lysine N-methyltransferase activity
- Specific function:
- Protein-lysine N-methyltransferase that monomethylates both histones and non-histone proteins. Specifically monomethylates 'Lys-20' of histone H4 (H4K20me1). H4K20me1 is enriched during mitosis and represents a specific tag for epigenetic transcriptional repression. Mainly functions in euchromatin regions, thereby playing a central role in the silencing of euchromatic genes. Required for cell proliferation, probably by contributing to the maintenance of proper higher-order structure of DNA during mitosis. Involved in chromosome condensation and proper cytokinesis. Nucleosomes are preferred as substrate compared to free histones. Mediates monomethylation of p53/TP53 at 'Lys-382', leading to repress p53/TP53-target genes. Plays a negative role in TGF-beta response regulation and a positive role in cell migration.
- Gene Name:
- KMT5A
- Uniprot ID:
- Q2YDJ8
- Molecular weight:
- 39277.0
- General function:
- Involved in histone-lysine N-methyltransferase activity
- Specific function:
- Putative histone methyltransferase that acts as a transcriptional repressor of smooth muscle gene expression. Promotes the transition from differentiated to proliferative smooth muscle by suppressing differentiation and maintaining the proliferative potential of vascular smooth muscle cells. Also plays a role in endothelial cells by inhibiting endothelial cell proliferation, survival and differentiation. It is unclear whether it has histone methyltransferase activity in vivo. According to some authors, it does not act as a histone methyltransferase by itself and represses transcription by recruiting EHMT2/G9a. According to others, it possesses histone methyltransferase activity when associated with other proteins and specifically methylates 'Lys-20' of histone H4 in vitro. 'Lys-20' methylation represents a specific tag for epigenetic transcriptional repression.
- Gene Name:
- PRDM6
- Uniprot ID:
- A6QPM3
- Molecular weight:
- 63989.0
- General function:
- Involved in histone-lysine N-methyltransferase activity
- Specific function:
- Not Available
- Gene Name:
- EHMT1
- Uniprot ID:
- A5PK11
- Molecular weight:
- 138734.0
- General function:
- Involved in chromatin binding
- Specific function:
- Histone methyltransferase that specifically trimethylates 'Lys-9' of histone H3 using monomethylated H3 'Lys-9' as substrate. H3 'Lys-9' trimethylation represents a specific tag for epigenetic transcriptional repression by recruiting HP1 (CBX1, CBX3 and/or CBX5) proteins to methylated histones. Mainly functions in heterochromatin regions, thereby playing a central role in the establishment of constitutive heterochromatin at pericentric and telomere regions. H3 'Lys-9' trimethylation is also required to direct DNA methylation at pericentric repeats. SUV39H1 is targeted to histone H3 via its interaction with RB1 and is involved in many processes, such as repression of MYOD1-stimulated differentiation, regulation of the control switch for exiting the cell cycle and entering differentiation, repression by the PML-RARA fusion protein, BMP-induced repression, repression of switch recombination to IgA and regulation of telomere length. Component of the eNoSC (energy-dependent nucleolar silencing) complex, a complex that mediates silencing of rDNA in response to intracellular energy status and acts by recruiting histone-modifying enzymes. The eNoSC complex is able to sense the energy status of cell: upon glucose starvation, elevation of NAD(+)/NADP(+) ratio activates SIRT1, leading to histone H3 deacetylation followed by dimethylation of H3 at 'Lys-9' (H3K9me2) by SUV39H1 and the formation of silent chromatin in the rDNA locus. Recruited by the large PER complex to the E-box elements of the circadian target genes such as PER2 itself or PER1, contributes to the conversion of local chromatin to a heterochromatin-like repressive state through H3 'Lys-9' trimethylation (By similarity).
- Gene Name:
- SUV39H1
- Uniprot ID:
- Q2NL30
- Molecular weight:
- 47846.0
- General function:
- Involved in DNA binding
- Specific function:
- Polycomb group (PcG) protein. Catalytic subunit of the PRC2/EED-EZH1 complex, which methylates 'Lys-27' of histone H3, leading to transcriptional repression of the affected target gene. Able to mono-, di- and trimethylate 'Lys-27' of histone H3 to form H3K27me1, H3K27me2 and H3K27me3, respectively. Required for embryonic stem cell derivation and self-renewal, suggesting that it is involved in safeguarding embryonic stem cell identity. Compared to EZH2-containing complexes, it is less abundant in embryonic stem cells, has weak methyltransferase activity and plays a less critical role in forming H3K27me3, which is required for embryonic stem cell identity and proper differentiation.
- Gene Name:
- EZH1
- Uniprot ID:
- A7E2Z2
- Molecular weight:
- 85285.0
- General function:
- Involved in histone-lysine N-methyltransferase activity
- Specific function:
- Histone methyltransferase that specifically methylates monomethylated 'Lys-20' (H4K20me1) and dimethylated 'Lys-20' (H4K20me2) of histone H4 to produce respectively dimethylated 'Lys-20' (H4K20me2) and trimethylated 'Lys-20' (H4K20me3) and thus regulates transcription and maintenance of genome integrity. In vitro also methylates unmodified 'Lys-20' (H4K20me0) of histone H4 and nucleosomes (By similarity). H4 'Lys-20' trimethylation represents a specific tag for epigenetic transcriptional repression. Mainly functions in pericentric heterochromatin regions, thereby playing a central role in the establishment of constitutive heterochromatin in these regions. KMT5B is targeted to histone H3 via its interaction with RB1 family proteins (RB1, RBL1 and RBL2) (By similarity). Plays a role in myogenesis by regulating the expression of target genes, such as EID3. Facilitates TP53BP1 foci formation upon DNA damage and proficient non-homologous end-joining (NHEJ)-directed DNA repair by catalyzing the di- and trimethylation of 'Lys-20' of histone H4 (By similarity). May play a role in class switch reconbination by catalyzing the di- and trimethylation of 'Lys-20' of histone H4 (By similarity).
- Gene Name:
- KMT5B
- Uniprot ID:
- Q29RP8
- Molecular weight:
- 44552.0
- General function:
- Involved in histone-lysine N-methyltransferase activity
- Specific function:
- Histone methyltransferase that methylates 'Lys-4' and 'Lys-36' of histone H3, 2 specific tags for epigenetic transcriptional activation. Specifically mediates dimethylation of H3 'Lys-36'.
- Gene Name:
- SETMAR
- Uniprot ID:
- Q0VD24
- Molecular weight:
- 34254.0
- General function:
- Amino acid transport and metabolism
- Specific function:
- Sorting receptor that directs prohormones to the regulated secretory pathway. Acts also as a prohormone processing enzyme in neuro/endocrine cells, removing dibasic residues from the C-terminal end of peptide hormone precursors after initial endoprotease cleavage.
- Gene Name:
- CPE
- Uniprot ID:
- P04836
- Molecular weight:
- 53309.0
- General function:
- Amino acid transport and metabolism
- Specific function:
- Not Available
- Gene Name:
- CPB1
- Uniprot ID:
- P00732
- Molecular weight:
- 47348.0
- General function:
- Amino acid transport and metabolism
- Specific function:
- Bifunctional enzyme that catalyzes the first two steps in lysine degradation. The N-terminal and the C-terminal contain lysine-oxoglutarate reductase and saccharopine dehydrogenase activity, respectively (By similarity).
- Gene Name:
- AASS
- Uniprot ID:
- A8E657
- Molecular weight:
- 102084.0
Reactions
L-Lysine + NADPH + Oxoglutaric acid → Saccharopine + NADP + Water | details |
- General function:
- Involved in copper ion binding
- Specific function:
- Active on elastin and collagen substrates.
- Gene Name:
- LOXL1
- Uniprot ID:
- Q95L39
- Molecular weight:
- 64496.0
- General function:
- Involved in copper ion binding
- Specific function:
- Responsible for the post-translational oxidative deamination of peptidyl lysine residues in precursors to fibrous collagen and elastin. Regulator of Ras expression. May play a role in tumor suppression. Plays a role in the aortic wall architecture (By similarity).
- Gene Name:
- LOX
- Uniprot ID:
- P33072
- Molecular weight:
- 47115.0
- General function:
- Involved in copper ion binding
- Specific function:
- May modulate the formation of a collagenous extracellular matrix.
- Gene Name:
- LOXL4
- Uniprot ID:
- Q8MJ24
- Molecular weight:
- 84050.0
- General function:
- Involved in iron ion binding
- Specific function:
- Part of a complex composed of PLOD1, P3H3 and P3H4 that catalyzes hydroxylation of lysine residues in collagen alpha chains and is required for normal assembly and cross-linkling of collagen fibrils (By similarity). Forms hydroxylysine residues in -Xaa-Lys-Gly- sequences in collagens (By similarity). These hydroxylysines serve as sites of attachment for carbohydrate units and are essential for the stability of the intermolecular collagen cross-links (By similarity).
- Gene Name:
- PLOD1
- Uniprot ID:
- O77588
- Molecular weight:
- 83487.0
- General function:
- Involved in ATP binding
- Specific function:
- Accepts ubiquitin from the E1 complex and catalyzes its covalent attachment to other proteins. In vitro catalyzes 'Lys-11'- and 'Lys-48'-, as well as 'Lys-63'-linked polyubiquitination. Participates in the regulation of transepithelial sodium transport in renal cells. May be involved in cell growth arrest.
- Gene Name:
- UBE2E3
- Uniprot ID:
- Q2T9X7
- Molecular weight:
- 22913.0
- General function:
- Involved in ATP binding
- Specific function:
- Catalyzes the covalent attachment of ubiquitin to other proteins. Functions in the E6/E6-AP-induced ubiquitination of p53/TP53. Promotes ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of FLT3.
- Gene Name:
- UBE2L6
- Uniprot ID:
- A5PJC4
- Molecular weight:
- 17825.0
- General function:
- Involved in ATP binding
- Specific function:
- Accepts the ubiquitin-like protein NEDD8 from the UBA3-NAE1 E1 complex and catalyzes its covalent attachment to other proteins. The specific interaction with the E3 ubiquitin ligase RBX2, but not RBX1, suggests that the RBX2-UBE2F complex neddylates specific target proteins, such as CUL5.
- Gene Name:
- UBE2F
- Uniprot ID:
- Q1RMW1
- Molecular weight:
- 21133.0
- General function:
- Involved in ATP binding
- Specific function:
- Ubiquitin-conjugating enzyme E2 that specifically acts with HECT-type and RBR family E3 ubiquitin-protein ligases. Does not function with most RING-containing E3 ubiquitin-protein ligases because it lacks intrinsic E3-independent reactivity with lysine: in contrast, it has activity with the RBR family E3 enzymes, such as PRKN and ARIH1, that function like function like RING-HECT hybrids. Accepts ubiquitin from the E1 complex and catalyzes its covalent attachment to other proteins. In vitro catalyzes 'Lys-11'-linked polyubiquitination. Involved in the selective degradation of short-lived and abnormal proteins. Down-regulated during the S-phase it is involved in progression through the cell cycle. Regulates nuclear hormone receptors transcriptional activity. May play a role in myelopoiesis.
- Gene Name:
- UBE2L3
- Uniprot ID:
- Q3MHP1
- Molecular weight:
- 17862.0
- General function:
- Involved in ATP binding
- Specific function:
- The UBE2V1-UBE2N and UBE2V2-UBE2N heterodimers catalyze the synthesis of non-canonical 'Lys-63'-linked polyubiquitin chains. This type of polyubiquitination does not lead to protein degradation by the proteasome. Mediates transcriptional activation of target genes. Plays a role in the control of progress through the cell cycle and differentiation. Plays a role in the error-free DNA repair pathway and contributes to the survival of cells after DNA damage. Acts together with the E3 ligases, HLTF and SHPRH, in the 'Lys-63'-linked poly-ubiquitination of PCNA upon genotoxic stress, which is required for DNA repair. Appears to act together with E3 ligase RNF5 in the 'Lys-63'-linked polyubiquitination of JKAMP thereby regulating JKAMP function by decreasing its association with components of the proteasome and ERAD. Promotes TRIM5 capsid-specific restriction activity and the UBE2V1-UBE2N heterodimer acts in concert with TRIM5 to generate 'Lys-63'-linked polyubiquitin chains which activate the MAP3K7/TAK1 complex which in turn results in the induction and expression of NF-kappa-B and MAPK-responsive inflammatory genes. Together with RNF135 and UB2V1, catalyzes the viral RNA-dependent 'Lys-63'-linked polyubiquitination of RIG-I/DDX58 to activate the downstream signaling pathway that leads to interferon beta production (By similarity).
- Gene Name:
- UBE2N
- Uniprot ID:
- Q0P5K3
- Molecular weight:
- 17138.0
- General function:
- Involved in ATP binding
- Specific function:
- Accepts ubiquitin from the E1 complex and catalyzes its covalent attachment to other proteins. In vitro catalyzes 'Lys-11'-, as well as 'Lys-48'-linked polyubiquitination. Cooperates with the E2 CDC34 and the SCF(FBXW11) E3 ligase complex for the polyubiquitination of NFKBIA leading to its subsequent proteasomal degradation. Acts as an initiator E2, priming the phosphorylated NFKBIA target at positions 'Lys-21' and/or 'Lys-22' with a monoubiquitin. Ubiquitin chain elongation is then performed by CDC34, building ubiquitin chains from the UBE2D3-primed NFKBIA-linked ubiquitin. Acts also as an initiator E2, in conjunction with RNF8, for the priming of PCNA. Monoubiquitination of PCNA, and its subsequent polyubiquitination, are essential events in the operation of the DNA damage tolerance (DDT) pathway that is activated after DNA damage caused by UV or chemical agents during S-phase. Associates with the BRCA1/BARD1 E3 ligase complex to perform ubiquitination at DNA damage sites following ionizing radiation leading to DNA repair. Targets DAPK3 for ubiquitination which influences promyelocytic leukemia protein nuclear body (PML-NB) formation in the nucleus. In conjunction with the MDM2 and TOPORS E3 ligases, functions ubiquitination of p53/TP53. Supports NRDP1-mediated ubiquitination and degradation of ERBB3 and of BRUCE which triggers apoptosis. In conjunction with the CBL E3 ligase, targets EGFR for polyubiquitination at the plasma membrane as well as during its internalization and transport on endosomes. In conjunction with the STUB1 E3 quality control E3 ligase, ubiquitinates unfolded proteins to catalyze their immediate destruction. Together with RNF135, catalyzes the viral RNA-dependent 'Lys-63'-linked polyubiquitination of RIG-I/DDX58 to activate the downstream signaling pathway that leads to interferon beta production (By similarity).
- Gene Name:
- UBE2D3
- Uniprot ID:
- Q3ZCF7
- Molecular weight:
- 16745.0
- General function:
- Involved in ATP binding
- Specific function:
- Accepts the ubiquitin-like protein NEDD8 from the UBA3-NAE1 E1 complex and catalyzes its covalent attachment to other proteins. The specific interaction with the E3 ubiquitin ligase RBX1, but not RBX2, suggests that the RBX1-UBE2M complex neddylates specific target proteins, such as CUL1, CUL2, CUL3 and CUL4. Involved in cell proliferation (By similarity).
- Gene Name:
- UBE2M
- Uniprot ID:
- A3KN22
- Molecular weight:
- 20900.0
- General function:
- Involved in ATP binding
- Specific function:
- Accepts ubiquitin from the E1 complex and catalyzes its covalent attachment to other proteins. E2 ubiquitin conjugating enzyme that transfers ubiquitin to MAEA, a core component of the CTLH E3 ubiquitin-protein ligase complex. In vitro catalyzes 'Lys-11'- and 'Lys-48'-linked polyubiquitination. Capable, in vitro, to ubiquitinate histone H2A.
- Gene Name:
- UBE2H
- Uniprot ID:
- Q32LN1
- Molecular weight:
- 20655.0
- General function:
- Amino acid transport and metabolism
- Specific function:
- Protects the body from potent vasoactive and inflammatory peptides containing C-terminal Arg or Lys (such as kinins or anaphylatoxins) which are released into the circulation.
- Gene Name:
- CPN1
- Uniprot ID:
- Q2KJ83
- Molecular weight:
- 52669.0
- General function:
- Involved in ATP binding
- Specific function:
- Accepts ubiquitin from the E1 complex and catalyzes its covalent attachment to other proteins. In vitro catalyzes 'Lys-11'- and 'Lys-48'-linked polyubiquitination. Acts as an essential factor of the anaphase promoting complex/cyclosome (APC/C), a cell cycle-regulated ubiquitin ligase that controls progression through mitosis. Acts by initiating 'Lys-11'-linked polyubiquitin chains on APC/C substrates, leading to the degradation of APC/C substrates by the proteasome and promoting mitotic exit.
- Gene Name:
- UBE2C
- Uniprot ID:
- Q32PA5
- Molecular weight:
- 19608.0
- General function:
- Involved in ATP binding
- Specific function:
- Accepts ubiquitin from the E1 complex and catalyzes its covalent attachment to other proteins. In vitro catalyzes 'Lys-48'-linked polyubiquitination.
- Gene Name:
- UBE2Q2
- Uniprot ID:
- Q32L27
- Molecular weight:
- 38717.0
- General function:
- Involved in ATP binding
- Specific function:
- Accepts ubiquitin from the E1 complex and catalyzes its covalent attachment to other proteins. In association with the E3 enzyme BRE1 (RNF20 and/or RNF40), it plays a role in transcription regulation by catalyzing the monoubiquitination of histone H2B at 'Lys-120' to form H2BK120ub1. H2BK120ub1 gives a specific tag for epigenetic transcriptional activation, elongation by RNA polymerase II, telomeric silencing, and is also a prerequisite for H3K4me and H3K79me formation. In vitro catalyzes 'Lys-11'-, as well as 'Lys-48'- and 'Lys-63'-linked polyubiquitination. Required for postreplication repair of UV-damaged DNA. Associates to the E3 ligase RAD18 to form the UBE2B-RAD18 ubiquitin ligase complex involved in mono-ubiquitination of DNA-associated PCNA on 'Lys-164'. May be involved in neurite outgrowth.
- Gene Name:
- UBE2B
- Uniprot ID:
- Q32P99
- Molecular weight:
- 17312.0
- General function:
- Involved in ATP binding
- Specific function:
- Accepts ubiquitin from the E1 complex and catalyzes its covalent attachment to other proteins. In vitro catalyzes 'Lys-48'-linked polyubiquitination. Mediates the selective degradation of short-lived and abnormal proteins. Functions in the E6/E6-AP-induced ubiquitination of p53/TP53. Mediates ubiquitination of PEX5 and autoubiquitination of STUB1 and TRAF6. Involved in the signal-induced conjugation and subsequent degradation of NFKBIA, FBXW2-mediated GCM1 ubiquitination and degradation, MDM2-dependent degradation of p53/TP53 and the activation of MAVS in the mitochondria by DDX58/RIG-I in response to viral infection. Essential for viral activation of IRF3.
- Gene Name:
- UBE2D2
- Uniprot ID:
- Q1RMX2
- Molecular weight:
- 16735.0
- General function:
- Involved in ATP binding
- Specific function:
- Catalyzes the covalent attachment of ubiquitin to other proteins. Seems to function in the selective degradation of misfolded membrane proteins from the endoplasmic reticulum (ERAD).
- Gene Name:
- UBE2J2
- Uniprot ID:
- Q2TA03
- Molecular weight:
- 28848.0
- General function:
- Involved in ATP binding
- Specific function:
- Accepts ubiquitin from the E1 complex and catalyzes its covalent attachment to other proteins. In vitro catalyzes 'Lys-48'-linked polyubiquitination. Involved in endoplasmic reticulum-associated degradation (ERAD).
- Gene Name:
- UBE2G2
- Uniprot ID:
- Q17QG5
- Molecular weight:
- 18552.0
- General function:
- Involved in ATP binding
- Specific function:
- Accepts ubiquitin from the E1 complex and catalyzes its covalent attachment to other proteins. In vitro catalyzes 'Lys-48'-linked polyubiquitination. Mediates the selective degradation of short-lived and abnormal proteins. Functions in the E6/E6-AP-induced ubiquitination of p53/TP53. Mediates ubiquitination of PEX5 and auto-ubiquitination of STUB1, TRAF6 and TRIM63/MURF1. Ubiquitinates STUB1-associated HSP90AB1 in vitro. Lacks inherent specificity for any particular lysine residue of ubiquitin. Essential for viral activation of IRF3. Mediates polyubiquitination of CYP3A4.
- Gene Name:
- UBE2D1
- Uniprot ID:
- Q2TA10
- Molecular weight:
- 16602.0
- General function:
- Involved in ATP binding
- Specific function:
- Accepts ubiquitin from the E1 complex and catalyzes its covalent attachment to other proteins. Catalyzes monoubiquitination. Involved in mitomycin-C (MMC)-induced DNA repair: acts as a specific E2 ubiquitin-conjugating enzyme for the Fanconi anemia complex by associating with E3 ubiquitin-protein ligase FANCL and catalyzing monoubiquitination of FANCD2, a key step in the DNA damage pathway. Also mediates monoubiquitination of FANCL and FANCI. May contribute to ubiquitination and degradation of BRCA1. In vitro able to promote polyubiquitination using all 7 ubiquitin Lys residues, but may prefer 'Lys-11'-, 'Lys-27'-, 'Lys-48'- and 'Lys-63'-linked polyubiquitination.
- Gene Name:
- UBE2T
- Uniprot ID:
- Q32LD2
- Molecular weight:
- 21765.0
- General function:
- Involved in ATP binding
- Specific function:
- Accepts ubiquitin from the E1 complex and catalyzes its covalent attachment to other proteins. In vitro, in the presence or in the absence of BRCA1-BARD1 E3 ubiquitin-protein ligase complex, catalyzes the synthesis of 'Lys-48'-linked polyubiquitin chains. Does not transfer ubiquitin directly to but elongates monoubiquitinated substrate protein. Mediates the selective degradation of short-lived and abnormal proteins, such as the endoplasmic reticulum-associated degradation (ERAD) of misfolded lumenal proteins. Ubiquitinates huntingtin. May mediate foam cell formation by the suppression of apoptosis of lipid-bearing macrophages through ubiquitination and subsequence degradation of p53/TP53 (By similarity). Proposed to be involved in ubiquitination and proteolytic processing of NF-kappa-B; in vitro supports ubiquitination of NFKB1.
- Gene Name:
- UBE2K
- Uniprot ID:
- P61085
- Molecular weight:
- 22407.0
- General function:
- Involved in ATP binding
- Specific function:
- Accepts ubiquitin from the E1 complex and catalyzes its covalent attachment to other proteins. Catalyzes 'Lys-11'-linked polyubiquitination. Acts as an essential factor of the anaphase promoting complex/cyclosome (APC/C), a cell cycle-regulated ubiquitin ligase that controls progression through mitosis. Acts by specifically elongating 'Lys-11'-linked polyubiquitin chains initiated by the E2 enzyme UBE2C/UBCH10 on APC/C substrates, enhancing the degradation of APC/C substrates by the proteasome and promoting mitotic exit. Also acts by elongating ubiquitin chains initiated by the E2 enzyme UBE2D1/UBCH5 in vitro; it is however unclear whether UBE2D1/UBCH5 acts as an E2 enzyme for the APC/C in vivo. Also involved in ubiquitination and subsequent degradation of VHL, resulting in an accumulation of HIF1A. In vitro able to promote polyubiquitination using all 7 ubiquitin Lys residues, except 'Lys-48'-linked polyubiquitination.
- Gene Name:
- UBE2S
- Uniprot ID:
- Q1RML1
- Molecular weight:
- 23896.0
- General function:
- Inorganic ion transport and metabolism
- Specific function:
- Plasma glycoprotein that binds a number of ligands such as heme, heparin, heparan sulfate, thrombospondin, plasminogen, and divalent metal ions. Inhibits rosette formation. Acts as an adapter protein and implicated in regulating many processes such as immune complex and pathogen clearance, cell adhesion, angiogenesis, coagulation and fibrinolysis. Mediates clearance of necrotic cells through enhancing the phagocytosis of necrotic cells in a heparan sulfate-dependent pathway. This process can be regulated by the presence of certain HRG ligands such as heparin and zinc ions. Binds to IgG subclasses of immunoglobins containing kappa and lambda light chains with different affinities regulating their clearance and inhibiting the formation of insoluble immune complexes. Tethers plasminogen to the cell surface. Binds T-cells and alters the cell morphology. Modulates angiogenesis by blocking the CD6-mediated antiangiongenic effect of thrombospondins, THBS1 and THBS2 (By similarity).
- Gene Name:
- HRG
- Uniprot ID:
- P33433
- Molecular weight:
- 44471.0
- General function:
- Amino acid transport and metabolism
- Specific function:
- Not Available
- Gene Name:
- SLC7A3
- Uniprot ID:
- A0JNF2
- Molecular weight:
- 67045.0
- General function:
- Not Available
- Specific function:
- Histone methyltransferase that specifically monomethylates 'Lys-4' of histone H3. H3 'Lys-4' methylation represents a specific tag for epigenetic transcriptional activation. Plays a central role in the transcriptional activation of genes.
- Gene Name:
- SETD7
- Uniprot ID:
- F1MUT0
- Molecular weight:
- 40648.0
Reactions
S-Adenosylmethionine + L-Lysine → S-Adenosylhomocysteine + N6,N6,N6-Trimethyl-L-lysine | details |